مطابق تعریف ماده یک قانون مقررات صادرات و واردات امور گمرکی کشور، گمرک سازمان منطقه آزاد واحدی از زیرمجموعه سازمان است که مجری مقررات صادرات و واردات در هر آن منطقه میباشد امور گمرکی سازمان منطقه آزاد قشم بر اساس قانون صادرات و واردات و امور گمرکی مناطق آزاد تجاری- صنعتی جمهوری اسلامی ایران برای مبادلات بازرگانی هرگونه کالا از خارج به داخل منطقه آزاد و برعکس و ورود و خروج مسافر از منطقه آزاد به خارج از کشور توسط مدیریت توسعه تجارت به انجام می‌رسد